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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

山东港口日照港2022年货物吞吐量突破5亿吨******url:https://m.gmw.cn/2022-12/27/content_1303236473.htm,id:1303236473

　　新华社客户端济南12月27日电（郭绪雷　刘书佳　刘言言）12月27日，随着“鸿洋”轮上的一个集装箱由远控岸桥放置在无人集卡上，山东港口日照港年度吞吐量突破5亿吨，稳居全国沿海港口第6位、世界第9位，实现新的历史跨越。

　　2022年，山东港口日照港8个货种过千万吨、7个货种居全国首位；集装箱完成580万标箱，位居全国沿海港口前10位；铁路拖运量突破1亿吨，居全国沿海港口铁路首位，月度日均装车最高突破4000车，瓦日铁路全年调进量2580万吨……用一组组数据，交上一张逆势发展亮眼答卷。

　　“我们一方面聚焦市场提升、效率提升、服务提升，强力推进十个主要货种吞吐量快速增长。另一方面，常态化开展攻坚会战，集疏港效率不断提升。”日照港生产业务部部长高海伟介绍说。

　　山东港口日照港积极抢抓国务院支持日照港“建设大宗干散货智慧绿色示范港口”机遇，大力实施石臼港区南区智慧绿色大宗干散货作业区流程化改造，加快实现机械化换人、自动化减人、智能化无人，较传统作业方式提高4.7倍，港口实现碳排放减少66％，港口转型发展不断迈上新台阶。

　　“我们FAX航线本年度在日照口岸的船舶直靠率和在泊作业效率大幅提升，位居全国各集装箱口岸前列，在港停时的减少对于提升我们的船舶周转率、降低运营成本具有极大的促进作用，也为客户带来了更加畅通顺达的物流服务体验。”安通控股股份有限公司山东片区日照网点主任车燕杰说。（完）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）